Согласно одной из гипотез, в некоторых тканях организма, в том числе в мозге, содержатся нанокристаллы магнетита (Fe3O4), предположительно, использовавшиеся предками человека как «внутренний компас» (доказано, например, что такие частицы помогают в ориентации голубям и другим животным). Возмущения магнитного поля действуют на эти частицы и раздражают рецепторы и мозговые структуры, вызывая у человека подобие стресса.
Другая гипотеза обращает внимание на то, что многие процессы в организме, такие как, например, генерация и проведение нервного импульса, с физической точки зрения являются электрическими токами и взаимодействуют с магнитным полем Земли.